这些论文与公司是什么关系
学术记录与合同业绩分开写，两边各有各的核对方法。
下列论文是公司核心成员的公开学术记录，发表时间跨度为 2021 至 2026 年。公司主体成立于 2026 年 8 月，这些论文不是公司主体的合同业绩，也不构成任何隶属关系的表述。把它们列在这里只说明一件事：承接方具备什么样的方法能力，以及这些能力被同行评议检验到什么程度。每一条都给了 DOI，可以直接核对。
加粗的署名是谁
本页加粗的署名 Yuquan Li 即黎育权本人，公开论文为其科研团队既往成果；公司日常运营与商务洽谈由陈维迅负责。公司登记信息可按公司全称在国家企业信用信息公示系统核对；上述论文可按 DOI 逐条核对，两者可以对上。
4 条方法主线，逐年推进
格子越深，这条线当年发表越多；一篇只归一条线。
- 分子表征与图神经网络5 篇
- 合成路线与反应条件4 篇
- 活性、选择性与亲和力3 篇
- 科学智能的方法学与生态2 篇
4 条主线分别做什么
- 分子表征与图神经网络5 篇
- 把分子结构变成机器能学的表示，是所有下游任务的地基。这条线上的方法被后续多个团队直接复用。
- 合成路线与反应条件4 篇
- 算出一个分子之后，还要回答「怎么做出来」。逆合成、反应条件与酶催化路线规划都在这条线上。
- 活性、选择性与亲和力3 篇
- 预测化合物与靶点结合得有多牢、以及会不会误伤别的靶点。选择性做不好，前面算得再准也没有意义。
- 科学智能的方法学与生态2 篇
- 参与撰写领域综述与开放科学倡议，对这个方向的边界与共识有第一手判断，不是只会跟着做。
发在哪里、署在第几位
署名位次对应期刊页面上的标记，不是自评。
| 署名位次 | 篇数 |
|---|---|
| 第一或共同第一作者 | 5 |
| 通讯作者 | 3 |
| 参与作者 | 6 |
三种位次各指什么
- 第一或共同第一作者
- 主导方法设计与主体实验的那一位。
- 通讯作者
- 对研究成立与否负最终责任、并对外承接质询的那一位。
- 参与作者
- 承担其中特定环节，署名位次按实际贡献排列。
全部 14 篇，按年份倒序
按方法主线筛选；标题与作者表在每张卡的展开里。
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2026活性、选择性
Adv. Sci.
参与作者
DOI标题与作者（照抄原文）
A Unified Hierarchical Multiscale Fusion Framework for Drug–Target Affinity Prediction: From Benchmark Performance to Nanomolar Inhibitor Discovery
Shuo Liu, Xiang Zhang, Haixia Feng, Yuquan Li, Xiaoqing Gong, Yong Liang*, Xiaojun Yao*, Huanxiang Liu*
Advanced Science · 2026 · 靶点亲和力预测 · doi:10.1002/advs.77345 · 在线优先发表，尚无卷期页。
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2026科学智能的方法学
The Innovation
第一或共同第一作者
DOI标题与作者（照抄原文）
AI for science: Progress, challenges, and perspectives
Yongjun Xu†, Zezhi Shao†, Xin Liu†, Yuquan Li†, Zhulin An†, Chenguang Fu†, et al.
The Innovation · 2026 · 科学智能综述 · doi:10.1016/j.xinn.2026.101530 · 由 140 位作者共同完成的领域综述，核心成员为共同第一作者之一、作者列表第 4 位。
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2026科学智能的方法学
Innov. Drug Discov.
通讯作者
DOI标题与作者（照抄原文）
Reshaping the drug discovery ecosystem with open science and collaborative innovation
Chaoyang Xie, Xiaorui Wang, Yawen Dong, Xiaojun Yao*, Gefei Hao*, Yuquan Li*
The Innovation Drug Discovery · 2026 · 开放科学与协同创新 · doi:10.59717/j.xinn-drugdisc.2026.100016
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2026分子表征
Adv. Sci.
通讯作者
DOI标题与作者（照抄原文）
Spectral Decomposition of Chemical Semantics for Activity Cliffs-Aware Molecular Property Prediction
Chaoyang Xie, Junhu Xu, Guangyi Huang, Shihang Wang, Mutian He, Xinyu Dong, Huiyang Hong, Xiaojun Yao, Qi Wang*, Yuquan Li*
Advanced Science · 2026 · 分子性质预测 · doi:10.1002/advs.202517579
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2026分子表征
Commun. Chem.
通讯作者
DOI标题与作者（照抄原文）
A hierarchical interaction message net for accurate molecular property prediction
Huiyang Hong, Xinkai Wu, Hongyu Sun, Chaoyang Xie, Qi Wang*, Yuquan Li*
Communications Chemistry · 2026 · 分子性质预测 · doi:10.1038/s42004-026-01922-x
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2025活性、选择性
Nat. Commun.
参与作者
DOI标题与作者（照抄原文）
Enhancing kinase-inhibitor activity and selectivity prediction through contrastive learning
Yanan Tian, Ruiqiang Lu, Xiaoqing Gong, Yuquan Li, Wei Zhao, Xiaorui Wang, Xinming Jia, Qin Li, Yuwei Yang, Henry H. Y. Tong, Joel P. Arrais*, Huanxiang Liu*, Xiaojun Yao*
Nature Communications · 2025 · 活性与选择性预测 · doi:10.1038/s41467-025-65869-8
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2025合成路线
Nat. Commun.
参与作者
DOI标题与作者（照抄原文）
A virtual platform for automated hybrid organic-enzymatic synthesis planning
Xiaorui Wang†, Xiaodan Yin†, Xujun Zhang†, Huifeng Zhao, Shukai Gu, Zhenxing Wu, Odin Zhang, Wenjia Qian, Yuansheng Huang, Yuquan Li, Dejun Jiang, Mingyang Wang, Huanxiang Liu, Xiaojun Yao*, Chang-Yu Hsieh*, Tingjun Hou*
Nature Communications · 2025 · 合成路线规划 · doi:10.1038/s41467-025-65898-3
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2025活性、选择性
Adv. Sci.
参与作者
DOI标题与作者（照抄原文）
Interpretable PROTAC Degradation Prediction With Structure-Informed Deep Ternary Attention Framework
Zhenglu Chen, Chunbin Gu*, Shuoyan Tan, Xiaorui Wang, Yuquan Li, Mutian He, Ruiqiang Lu, Shijia Sun, Chang-Yu Hsieh*, Xiaojun Yao*, Huanxiang Liu*, Pheng-Ann Heng
Advanced Science · 2025 · 蛋白降解剂建模 · doi:10.1002/advs.202508138
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2024合成路线
Nat. Commun.
参与作者
DOI标题与作者（照抄原文）
Multi-modal deep learning enables efficient and accurate annotation of enzymatic active sites
Xiaorui Wang, Xiaodan Yin, Dejun Jiang, Huifeng Zhao, Zhenxing Wu, Odin Zhang, Jike Wang, Yuquan Li, Yafeng Deng, Huanxiang Liu, Pei Luo, Yuqiang Han, Tingjun Hou*, Xiaojun Yao*, Chang-Yu Hsieh*
Nature Communications · 2024 · 酶活性位点标注 · doi:10.1038/s41467-024-51511-6
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2023合成路线
Research
参与作者
DOI标题与作者（照抄原文）
Generic Interpretable Reaction Condition Predictions with Open Reaction Condition Datasets and Unsupervised Learning of Reaction Center
Xiaorui Wang†, Chang-Yu Hsieh†, Xiaodan Yin, Jike Wang, Yuquan Li, Yafeng Deng, Dejun Jiang, Zhenxing Wu, Hongyan Du, Hongming Chen, Yun Li, Huanxiang Liu, Yuwei Wang, Pei Luo, Tingjun Hou*, Xiaojun Yao*
Research · 2023 · 反应条件预测 · doi:10.34133/research.0231
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2022分子表征
Nat. Mach. Intell.
第一或共同第一作者
DOI标题与作者（照抄原文）
An adaptive graph learning method for automated molecular interactions and properties predictions
Yuquan Li†, Chang-Yu Hsieh†, Ruiqiang Lu, Xiaoqing Gong, Xiaorui Wang, Pengyong Li, Shuo Liu, Yanan Tian, Dejun Jiang, Jiaxian Yan, Qifeng Bai, Huanxiang Liu, Shengyu Zhang, Xiaojun Yao*
Nature Machine Intelligence · 2022 · 分子表征与图学习 · doi:10.1038/s42256-022-00501-8 · 第 4 卷第 7 期，645–651 页。
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2021分子表征
Brief. Bioinform.
第一或共同第一作者
DOI标题与作者（照抄原文）
TrimNet: learning molecular representation from triplet messages for biomedicine
Pengyong Li†, Yuquan Li†, Chang-Yu Hsieh, Shengyu Zhang, Xianggen Liu, Huanxiang Liu, Sen Song*, Xiaojun Yao*
Briefings in Bioinformatics · 2021 · 分子表征与图学习 · doi:10.1093/bib/bbaa266 · 第 22 卷第 4 期。
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2021合成路线
Chem. Eng. J.
第一或共同第一作者
DOI标题与作者（照抄原文）
RetroPrime: A Diverse, plausible and Transformer-based method for Single-Step retrosynthesis predictions
Xiaorui Wang†, Yuquan Li†, Jiezhong Qiu, Guangyong Chen, Huanxiang Liu, Benben Liao*, Chang-Yu Hsieh*, Xiaojun Yao*
Chemical Engineering Journal · 2021 · 逆合成路线预测 · doi:10.1016/j.cej.2021.129845 · 第 420 卷，文章号 129845。
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2021分子表征
Chem. Eng. J.
第一或共同第一作者
DOI标题与作者（照抄原文）
Introducing block design in graph neural networks for molecular properties prediction
Yuquan Li, Pengyong Li, Xing Yang, Chang-Yu Hsieh, Shengyu Zhang, Xiaorui Wang, Ruiqiang Lu, Huanxiang Liu, Xiaojun Yao*
Chemical Engineering Journal · 2021 · 分子表征与图学习 · doi:10.1016/j.cej.2021.128817 · 第 414 卷，文章号 128817。
4 家有共同署名或驻场记录的机构
按起始年排开；右侧矩阵是每家机构在各主线上的共同署名篇数。
每家机构的依据
- 腾讯量子实验室 · 2020.8 – 2022.6
- 核心成员以实地校企联合培养的方式在该实验室驻场，从事人工智能制药方向研究。论文上印有该实验室单位的共同署名集中在驻场期间。
- 北京智源人工智能研究院 · 2022.7 – 2023.4
- 核心成员在该院研究团队驻场，参与大模型与科学计算交叉方向的研究工作。本页论文中没有印该院单位的，这一条的依据是驻场本身。
- 澳门理工大学 · 应用科学学院 · 2023 至今
- 与该院研究人员长期共同署名，覆盖分子表征、反应条件、活性与选择性、蛋白降解剂建模。只计论文上印有该院单位的篇目。
- 浙江大学 · 药学院 · 2023 至今
- 与该院研究人员共同署名发表反应条件预测、酶活性位点标注、合成路线规划与蛋白降解剂建模方向的论文。只计论文上印有该院单位的篇目。
读者自己怎么核实，4 步
每一步都不需要任何授权。
每一步具体怎么做
- 按 DOI 直查
- 把任意一条的 DOI 粘进 doi.org，会跳到该期刊的正式页面，作者顺序与本页一致。
- 按标题查公开数据库
- 标题在 Crossref、PubMed 与各大学术检索平台上均可检索到，不需要任何授权。
- 核对署名位次
- 本页标注的「第一作者／通讯作者」在期刊页面上有对应标记，不是自评。
- 要一份完整清单
- 本页只列同行评议的英文期刊论文。中文论文、教改论文、专利与软件著作权可在洽谈时另附清单。